基因序列格式化工具
本工具可以去除基因序列中的非法字符,可以自定义每行输出碱基数,每列碱基数。
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常见物种密码子使用频率表
通过本工具可以查看常见蛋白表达系统及常见物种的密码子使用频率表。密码子使用频率表在计算密码子偏爱性和稀有密码子时有重要作用
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密码子使用频率计算器
如果你有一段基因序列,通过此工具可以计算出你的基因的密码子使用频率情况,输出格式与《常见物种密码子使用频率表》相同。
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稀有密码子分析
此工具根据宿主细胞的基因组的密码子使用频率,计算出目标序列的密码子使用情况分布。如果稀有密码子使用较多,则会影响异源表达。
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GC含量计算器
此工具可以计算基因序列的GC含量分布图,如果在特定区域,GC含量过高则会影响转录效率。
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密码子表差异
查看不同类型的密码子表。在对比中可以查看相同的密码子对应不同的氨基酸或者起始/终止密码。
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密码子偏爱性计算器
根据目标宿主表达系统的密码子使用频率表计算出目的基因的密码子适用指数。如果低于0.8,需要优化目标序列才好表达。
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氨基酸属性表
查看氨基酸的酸碱性、极性、亲疏水性、分子量、质谱分子量等信息,并可以根据信息看到同重分子。
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信号肽分析
本工具通过远程获取signalP的数据,用于分析信号肽。可以指导基因的异源表达的设计。
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跨膜区分析
本工具通过远程获取跨膜区分析工具的数据,用于分析蛋白跨膜区。可以指导基因的异源表达的设计。
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蛋白抗原决定簇预测(工具一)
此工具可以展示四种蛋白抗原决定簇预测算法的数据,帮助进行抗原多肽的设计。
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蛋白抗原决定簇预测(工具二)
此工具通过远程调用的方式获取BepiPred的数据,并通过曲线方式呈现数据。帮助进行抗原多肽的设计。
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蛋白序列格式化工具
本工具可以去除氨基酸序列中的非法字符,可以自定义每行输出碱基数,每列碱基数
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亲水性分析工具
此工具集成了 Kyte-Doolittle算法,展示了蛋白序列的疏水性分布。
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